Geometric, Feature- and Graph-based Analysis of Protein Structures

Sprache: Englisch

Verlag: Südwestdeutscher Verlag Für Hochschulschriften AG Co. KG Jul 2015, 2015

3838134796 / 9783838134796

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This item is printed on demand - it takes 3-4 days longer - Neuware -The structural comparison of whole proteins or protein binding sites is usually performed by making use of graphs. Even though graphs exhibit a lot of interesting and useful properties, the usage of other representations can come along with several benefits. In this book the representation of a protein binding site is tackled. Three representations are considered namely the geometric, the feature-based and the graph-based representation. For all three types, some completely new algorithms are developed and presented. Moreover, existing methods are adapted to the application of protein binding sites' comparison. In addition, algorithms for the construction of multiple structural alignments are presented as a structural counterpart to multiple sequence alignment. By considering four different types of experiments, namely classification, similarity retrieval, clustering and construction of structural alignments, strengths and weaknesses of the proposed methods are detected and discussed. In addition a hybrid approach is presented which combines the benefits of a feature-based and a geometric method leading to a significant speed-up while still holding very good results. 404 pp. Englisch. …

Bestandsnummer des Verkäufers 9783838134796

Titel
Geometric, Feature- and Graph-based Analysis of Protein Structures
Autor
Thomas Fober
Verlag
Südwestdeutscher Verlag Für Hochschulschriften AG Co. KG Jul 2015
Erscheinungsjahr
2015
Zustand
Neu
Einband
Taschenbuch
Sprache
Englisch
ISBN-10
3838134796
ISBN-13
9783838134796
Artikelgewicht
620 Gramm
Abmessungen
220x150x25 mm

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