Metagenomic Data Analysis

Sprache: Englisch

Verlag: Humana Jun 2023, 2023

1071630717 / 9781071630716

Serie: Buch 272 von 382 - Methods in Molecular Biology

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This item is printed on demand - it takes 3-4 days longer - Neuware -This volume describes different sequencing methods, pipelines and tools for metagenome data analyses. Chapters guide readers through quality control of raw sequence data, metagenomics databases for bacterial annotations suchGreengenes, SILVA, RDP and GTDB, guide to 16S rRNA microbiome analysis and pipelines such asmothur, DADA2,QIIME2, whole genome shotgun metagenomics data analyses pipeline using MEGAN and DIAMOND, web service such as PATRIC, RDP, mothur, Kaiju, PhyloPythiaS, MG-RAST, WebMGA, MicrobiomeAnalyst, WHAM!, METAGENassist and MGnify: EBI-Metagenomics, MG-RAST Metagenomics Analysis. Then the chapters inform the readers regarding Third-generation sequencing (TGS) approachesas MinION sequencing and teaches use ofUbuntu Linux Virtual Machine configuration, clinical and environmental resistomes, use of FISH techniques and designing FISH probes, protocols for viral metagenomics, and comprehensive guideline for microbiome analysis usingmost used R packages. Written in the format of the highly successfulMethods in Molecular Biologyseries, each chapter includes an introduction to the topic, lists necessary materials and methods, includes tips on troubleshooting and known pitfalls, and step-by-step, readily reproducible protocols.Authoritative and cutting-edge,Metagenomic Data Analysis: Methods and Protocols aims to be comprehensive guide for researchers to specialize in the metagenomics field. 456 pp. Englisch.…

Bestandsnummer des Verkäufers 9781071630716

Titel
Metagenomic Data Analysis
Autor
Suparna Mitra
Verlag
Humana Jun 2023
Erscheinungsjahr
2023
Zustand
Neu
Einband
Buch
Sprache
Englisch
ISBN-10
1071630717
ISBN-13
9781071630716
Artikelgewicht
1.048 Gramm
Abmessungen
260x183x30 mm
Serie
Buch 272 von 382: Methods in Molecular Biology

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