Metagenomic Data Analysis

Sprache: Englisch

Verlag: Humana Jun 2023, 2023

1071630741 / 9781071630747

Serie: Buch 272 von 382 - Methods in Molecular Biology

Anbieter: BuchWeltWeit Ludwig Meier e.K., Bergisch Gladbach, DeutschlandBuchWeltWeit Ludwig Meier e.K.

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This item is printed on demand - it takes 3-4 days longer - Neuware -This volume describes different sequencing methods, pipelines and tools for metagenome data analyses. Chapters guide readers through quality control of raw sequence data, metagenomics databases for bacterial annotations suchGreengenes, SILVA, RDP and GTDB, guide to 16S rRNA microbiome analysis and pipelines such asmothur, DADA2,QIIME2, whole genome shotgun metagenomics data analyses pipeline using MEGAN and DIAMOND, web service such as PATRIC, RDP, mothur, Kaiju, PhyloPythiaS, MG-RAST, WebMGA, MicrobiomeAnalyst, WHAM!, METAGENassist and MGnify: EBI-Metagenomics, MG-RAST Metagenomics Analysis. Then the chapters inform the readers regarding Third-generation sequencing (TGS) approachesas MinION sequencing and teaches use ofUbuntu Linux Virtual Machine configuration, clinical and environmental resistomes, use of FISH techniques and designing FISH probes, protocols for viral metagenomics, and comprehensive guideline for microbiome analysis usingmost used R packages. Written in the format of the highly successfulMethods in Molecular Biologyseries, each chapter includes an introduction to the topic, lists necessary materials and methods, includes tips on troubleshooting and known pitfalls, and step-by-step, readily reproducible protocols.Authoritative and cutting-edge,Metagenomic Data Analysis: Methods and Protocols aims to be comprehensive guide for researchers to specialize in the metagenomics field. 456 pp. Englisch.

Bestandsnummer des Verkäufers 9781071630747

Titel
Metagenomic Data Analysis
Autor
Suparna Mitra
Verlag
Humana Jun 2023
Veröffentlichungsjahr
2023
Zustand
Neu
Einband
Taschenbuch
Sprache
Englisch
ISBN-10
1071630741
ISBN-13
9781071630747
Artikelgewicht
851 Gramm
Abmessungen
254x178x25 mm
Serie
Buch 272 von 382: Methods in Molecular Biology

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