Protein Homology Detection Through Alignment of Markov Random Fields

Sprache: Englisch

Verlag: Springer International Publishing AG, CH, 2015

331914913X / 9783319149134

Serie: Buch 170 von 322 - SpringerBriefs in Computer Science

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This work covers sequence-based protein homology detection, a fundamental and challenging bioinformatics problem with a variety of real-world applications. The text first surveys a few popular homology detection methods, such as Position-Specific Scoring Matrix (PSSM) and Hidden Markov Model (HMM) based methods, and then describes a novel Markov Random Fields (MRF) based method developed by the authors. MRF-based methods are much more sensitive than HMM- and PSSM-based methods for remote homolog detection and fold recognition, as MRFs can model long-range residue-residue interaction. The text also describes the installation, usage and result interpretation of programs implementing the MRF-based method.

Bestandsnummer des Verkäufers LU-9783319149134

Titel
Protein Homology Detection Through Alignment of Markov Random Fields
Autor
Jinbo Xu, Sheng Wang, Jianzhu Ma
Verlag
Springer International Publishing AG, CH
Veröffentlichungsjahr
2015
Zustand
New
Einband
Paperback
Sprache
Englisch
ISBN-10
331914913X
ISBN-13
9783319149134
Serie
Buch 170 von 322: SpringerBriefs in Computer Science

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