Computational analysis of natural science experiments often confronts noisy data due to natural variability in environment or measurement. Drawing conclusions in the face of such noise entails a statistical analysis. Parametric statistical methods assume that the data is a sample from a population that can be characterized by a specific distribution (e.g., a normal distribution). When the assumption is true, parametric approaches can lead to high confidence predictions. However, in many cases particular distribution assumptions do not hold. In that case, assuming a distribution may yield false conclusions. The companion book Statistics is Easy, gave a (nearly) equation-free introduction to nonparametric (i.e., no distribution assumption) statistical methods. The present book applies data preparation, machine learning, and nonparametric statistics to three quite different life science datasets. We provide the code as applied to each dataset in both R and Python 3. We also include exercises for self-study or classroom use.

�ber die Autorin bzw. den Autor

Manpreet Singh Katari is a Clinical Associate Professor and the Coordinator of Computational Studies in the Biology Department of New York University. In addition to teaching courses ranging from Statistics, Programming, Machine Learning, and Analysis of Next-Generation Sequencing Data, he also collaborates with researchers in the area of Plant Systems Biology. His main passion is in developing software that empowers researchers to analyze, integrate, and visualize large-scale genomic datasets. Although his work has been primarily in the model plant species Arabidopsis thaliana he has applied his knowledge to many crops, such as Rice, Corn, Banana, and Cassava, and also to human disease datasets such as cancer.

Sudarshini Tyagi is currently a software engineer at Goldman Sachs where she uses machine learning particularly natural language processing and statistics to detect anomalies in financial regulations. She received her Master’s degree in Computer Science from Courant Institute of Mathematical Sciences at New York University, where she wrote a thesis on visually detecting breast cancers from mammograms. She also holds a Bachelor’s degree in Computer Science from Rashtreeya Vidyalaya College of Engineering, Bengaluru.

Dennis Shasha is a Julius Silver Professor of Computer Science at the Courant Institute of New York University and an Associate Director of NYU Wireless. In addition to his long fascination with nonparametric statistics, he works on meta-algorithms for machine learning to achieve guaranteed correctness rates; with biologists on pattern discovery for network inference; with physicists and financial people on algorithms for time series; on database tuning; and tree and graph matching. Because he likes to type, he has written six books of puzzles about a mathematical detective named Dr. Ecco, a biography about great computer scientists, and a book about the future of computing. He has also written technical books about database tuning, biological pattern recognition, time series, DNA computing, resampling statistics, and causal inference in molecular networks. He has written the puzzle column for various publications including Scientific American, Dr. Dobb’s Journal, and currently the Communications of the ACM. He is a fellow of the ACM and an INRIA International Chair.

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WIDERRUFSBELEHRUNG

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Sie haben das Recht, binnen vierzehn Tagen ohne Angabe von Gr�nden diesen Vertrag zu widerrufen.

Die Widerrufsfrist betr�gt vierzehn Tage ab dem Tag, an dem Sie oder ein von Ihnen benannter Dritter, der nicht der Bef�rderer ist, die letzte Ware oder die letzte Teilsendung bzw. das letzte St�ck in Besitz genommen haben bzw. hat.

Um Ihr Widerrufsrecht auszu�ben, m�ssen Sie uns, Revaluation Books, Exstowe, Exton, EX3 0PP, Exeter, United Kingdom, 44 1179083586, mittels einer eindeutigen Erkl�rung (z.B. ein mit der Post versandter Brief, Telefax oder E-Mail) �ber Ihren Entschluss, diesen Vertrag zu widerrufen, informieren. Sie k�nnen daf�r das beigef�gte Muster-Widerrufsformular verwenden, das jedoch nicht vorgeschrieben ist. Sie k�nnen auch eine andere eindeutige Erkl�rung auf der Webseite "Meine Bestellungen" in Ihrem "Nutzerkonto" elektronisch ausf�llen und �bermitteln. Machen Sie von dieser M�glichkeit Gebrauch, so werden wir Ihnen unverz�glich (z. B. per E-Mail) eine Best�tigung �ber den Eingang eines solchen Widerrufs �bermitteln. Zur Wahrung der Widerrufsfrist reicht es aus, dass Sie die Mitteilung �ber die Aus�bung des Widerrufsrechts vor Ablauf der Widerrufsfrist absenden.

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Wenn Sie diesen Vertrag widerrufen, haben wir Ihnen alle Zahlungen, die wir von Ihnen erhalten haben, einschlie�lich der Lieferkosten (mit Ausnahme der zus�tzlichen Kosten, die sich daraus ergeben, dass Sie eine andere Art der Lieferung als die von uns angebotene, g�nstigste Standardlieferung gew�hlt haben), unverz�glich und sp�testens binnen vierzehn Tagen ab dem Tag zur�ckzuzahlen, an dem die Mitteilung �ber Ihren Widerruf dieses Vertrags bei uns eingegangen ist. F�r diese R�ckzahlung verwenden wir dasselbe Zahlungsmittel, das Sie bei der urspr�nglichen Transaktion eingesetzt haben, es sei denn, mit Ihnen wurde ausdr�cklich etwas anderes vereinbart; in keinem Fall werden Ihnen wegen dieser R�ckzahlung Entgelte berechnet. Wir k�nnen die R�ckzahlung verweigern, bis wir die Waren wieder zur�ckerhalten haben oder bis Sie den Nachweis erbracht haben, dass Sie die Waren zur�ckgesandt haben, je nachdem, welches der fr�here Zeitpunkt ist. Sie haben die Waren unverz�glich und in jedem Fall sp�testens binnen vierzehn Tagen ab dem Tag, an dem Sie uns �ber den Widerruf dieses Vertrags unterrichten, an Revaluation Books, Edward Bowditch Ltd, Clifton Heights, Triangle West, BS8 1EJ, Bristol, United Kingdom, 44 1179083586, zur�ckzusenden oder zu �bergeben. Die Frist ist gewahrt, wenn Sie die Waren vor Ablauf der Frist von vierzehn Tagen absenden.

Sie tragen die unmittelbaren Kosten der R�cksendung der Waren. Sie m�ssen f�r einen etwaigen Wertverlust der Waren nur aufkommen, wenn dieser Wertverlust auf einen zur Pr�fung der Beschaffenheit, Eigenschaften und Funktionsweise der Waren nicht notwendigen Umgang mit ihnen zur�ckzuf�hren ist.

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